Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trex1Q91XB0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trex1Q91XB0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trex1Q91XB0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trex1Q91XB0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trex1Q91XB0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trex1Q91XB0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trex1Q91XB0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trex1Q91XB0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trex1Q91XB0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trex1Q91XB0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trex1Q91XB0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms