Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Csde1Q91W50 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csde1Q91W50 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms