Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Klc3Q91W40 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Klc3Q91W40 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms