Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fyco1Q8VDC1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fyco1Q8VDC1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Fyco1Q8VDC1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms