Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d2Q8VD57 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d2Q8VD57 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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