Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc18Q8VD24 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zcchc18Q8VD24 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zcchc18Q8VD24 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms