Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn4Q8VCH8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn4Q8VCH8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn4Q8VCH8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms