Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajc28Q8VCE1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms