Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm4cQ8VCD7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm4cQ8VCD7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm4cQ8VCD7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms