Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
0610009B22RikQ8R3W2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
0610009B22RikQ8R3W2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms