Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc12Q8R344 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc12Q8R344 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms