Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colec12Q8K4Q8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colec12Q8K4Q8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136 ms