Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hecw1Q8K4P8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Hecw1Q8K4P8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Hecw1Q8K4P8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms