Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pof1bQ8K4L4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pof1bQ8K4L4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pof1bQ8K4L4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms