Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Lrrtm1Q8K377 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrrtm1Q8K377 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms