Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stn1Q8K2X3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stn1Q8K2X3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stn1Q8K2X3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms