Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fcho1Q8K285 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fcho1Q8K285 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms