Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim68Q8K243 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim68Q8K243 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim68Q8K243 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim68Q8K243 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim68Q8K243 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim68Q8K243 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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