Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sde2Q8K1J5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sde2Q8K1J5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sde2Q8K1J5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sde2Q8K1J5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms