Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnma3Q8JZW8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pnma3Q8JZW8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pnma3Q8JZW8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms