Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne5Q8JZW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne5Q8JZW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms