Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ago4Q8CJF8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ago4Q8CJF8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ago4Q8CJF8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms