Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NgefQ8CHT1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NgefQ8CHT1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NgefQ8CHT1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms