Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Upp2Q8CGR7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp2Q8CGR7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms