Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tcerg1Q8CGF7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tcerg1Q8CGF7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcerg1Q8CGF7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tcerg1Q8CGF7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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