Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ercc8Q8CFD5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ercc8Q8CFD5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ercc8Q8CFD5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ercc8Q8CFD5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ercc8Q8CFD5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc8Q8CFD5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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