Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klf17Q8CFA7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf17Q8CFA7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms