Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcas3Q8CCN5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas3Q8CCN5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcas3Q8CCN5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms