Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf20l1Q8CCJ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phf20l1Q8CCJ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf20l1Q8CCJ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms