Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Nhlrc3Q8CCH2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Nhlrc3Q8CCH2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Nhlrc3Q8CCH2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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