Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8C708 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8C708 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q8C708 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q8C708 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q8C708 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q8C708 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8C708 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Q8C708 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C708 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C708 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C708 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C708 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C708 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C708 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C708 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8C708 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms