Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cwc22Q8C5N3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc22Q8C5N3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cwc22Q8C5N3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms