Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccz1Q8C1Y8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccz1Q8C1Y8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccz1Q8C1Y8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms