Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Strip1Q8C079 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Strip1Q8C079 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Strip1Q8C079 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms