Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TnrQ8BYI9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TnrQ8BYI9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TnrQ8BYI9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms