Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TtpaQ8BWP5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TtpaQ8BWP5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms