Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx17Q8BVL3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx17Q8BVL3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx17Q8BVL3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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