Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scfd2Q8BTY8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scfd2Q8BTY8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms