Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PcgF3Q8BTQ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcgF3Q8BTQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms