Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trmt2aQ8BNV1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trmt2aQ8BNV1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trmt2aQ8BNV1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trmt2aQ8BNV1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trmt2aQ8BNV1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt2aQ8BNV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt2aQ8BNV1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms