Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prpf18Q8BM39 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prpf18Q8BM39 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prpf18Q8BM39 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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