Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd55Q8BLD6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ankrd55Q8BLD6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms