Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp54Q8BL06 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp54Q8BL06 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp54Q8BL06 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Usp54Q8BL06 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms