Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fndc9Q8BJN4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc9Q8BJN4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fndc9Q8BJN4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms