Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smarcal1Q8BJL0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smarcal1Q8BJL0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms