Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo28Q8BIG4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo28Q8BIG4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms