Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbfox3Q8BIF2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbfox3Q8BIF2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms