Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vipas39Q8BGQ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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Vipas39Q8BGQ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Vipas39Q8BGQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Vipas39Q8BGQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Vipas39Q8BGQ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Vipas39Q8BGQ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vipas39Q8BGQ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Vipas39Q8BGQ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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