Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pknox2Q8BG99 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms