Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.5Q85ZW7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.5Q85ZW7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.5Q85ZW7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-M10.5Q85ZW7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-M10.5Q85ZW7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms